Главная » Темы НИР » Внутренние гранты » Поиск новых молекулярных мишеней для предиктивной диагностики мужского бесплодия

Поиск новых молекулярных мишеней для предиктивной диагностики мужского бесплодия

ВнГр-07/2017-34
Дата начала работ: 01.01.2017 Дата окончания работ: 31.12.2018

Объем финансирования: 1 400 000 руб.
Ответственный исполнитель: Шкурат Т.П.
Cписок исполнителей: Александрова А.А., Бутенко Е.В., Косенко П.О., Лянгасова О.В., Шерчкова Т.А., Лебедева Ю.А., Герасименко М.В., Старкова Д.С.

Номер РК: АААА-А17-117061310098-1

Аннотация

Совместный проект с Ереванским государственным университетом (г. Ереван, Армения).

Цель проекта: Изучение генетических и эпигенетических механизмов регуляции сперматогенеза и поиск новых молекулярных мишеней для предиктивной диагностики мужского бесплодия у пациентов из Армении и России.

По результатам анализа спермограмм и на основании руководства ВОЗ (WНO, 2010) будут сформированы группы пациентов. Оценка морфологии сперматозоидов будет проводиться в соответствии со схематическими изображениями, приведенными в работе Т. Кruger е.а., 1993. Спермограмма будет проведена на автоматическом спермоанализаторе SQA-V. ДНК и микроРНК будут выделяться из сперматозоидов с применением коммерческих комплектов реагентов «AmpliPrime-DNА-sоrЬ-АМ» и «miRNeasy Mini Kit», соответственно, согласно протоколу изготовителя. Полученные образцы будут храниться при температуре -80С° до анализа с применением количественной ПЦР на экспериментальной базе ЮФУ. Аллельные варианты исследуемых генов будут изучены с использованием наборов реагентов SNP-экспресс (Литех, Москва). Анализ основан на проведении реакций амплификации с двумя парами аллель-специфичных праймеров. Для анализа повреждений ДНК будет использован метод ДНК-комет (Hughes et al., 1996) и метод расчета индекса фрагментации ДНК (DFI) с использованием наборов Holosperm (Испания) с окраской по Райту. Анализ глобального метилирования ДНК будет проведен также с использованием метода ДНК-комет (Wentzel et al., 2010). Изображения комет будут регистрироваться видеокамерой (Variocam, РСО, Германия) и анализироваться с помощью программы Comet Assay IV (Version 4.3). Статистический анализ будет проведен с применением теста Манн-Уитни. Данные будут обрабатываться статистической программой IBM SPSS Statistics 19. Соответствие распределения частот генотипов равновесию Харди-Вайнберга будет определяться с использованием Hardy-Weinberg equilibrium calculator в программе (Rodriguez et al., 2009). Оценка различий в распределении аллельных вариантов генов в обследованных группах будет осуществляться по критерию χ2.

Публикации:
Александрова А.А. ДНК-фрагментация сперматозоидов и анализ частот FISH-анеуплоидии при различных типах патоспермииАлександрова А.А., Шкурат М.А., Мальцева А.Н., Арутюнян Т.А., Арутюнян Р.М. // Мат. Научно-практической конференции с международным участием «Генетика - фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции», Ростов-на-Дону, 2-4 ноября 2017. – С. 129-130.
Шерчкова Т.А. Ассоциации полиморфизмов гена XRCC1 Arg280His и Arg399Gln с различными патологиями сперматогенезаШерчкова Т.А., Ломтева С.В., Сагамонова К.Ю., Лянгасова О.В., Александрова А.А., Шкурат Т.П. // Мат. XXVII Международной конференции РАРЧ, Санкт-Петербург, 6-9 сентября 2017. – С. 261-262.
Скачать (96,87 KB)
Герасименко М.В. МикроРНК как маркеры мужского бесплодия (обзор) [Электронный ресурс] / Герасименко М.В. // Живые и биокосные системы. — 2017. — № 20. URL: http://www.jbks.ru/archive/issue-20/article-4 (дата обращения ).
Герасименко М.В. Вклад полиморфных вариантов генов фолатного цила, участвующих в метилировании ДНК, в развитие патоспермии / Герасименко М.В., Бутенко Е.В., Лянгасова О.В., Арутюнян Т.А., Авагян А.Л., Шкурат Т.П. // Валеология. — 2017. —  № 4. — С. 66-73.
Грабарь В.А. Функциональная аннотация генов, локализованных на Y - хромосоме человека [Электронный ресурс] / Грабарь В.А., Казарьянц А.Э. // Живые и биокосные системы. — 2017. — № 22. URL: http://www.jbks.ru/archive/issue-22/article-5 (дата обращения ).